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Megan Lee nació y se crió en el área de Washington DC. Uno de tres hermanos, ella es el bebé en la familia. Se graduó de la escuela de ciencia y tecnología Eleanor Roosevelt High School. Obtuvo una licenciatura en biología de la Universidad George Mason, donde se centró en genética, inmunología y microbiología. Actualmente tiene una carrera en investigación biomédica de enfermedades transmisibles.